Das PHIS wurde während einer mehrjährigen Projektphase an der Vetsuisse-Fakultät in Bern und Zürich in Kooperation mit der Berner Fachhochschule Technik & Informatik entwickelt und aufgebaut. Die wichtigsten Stakeholder der Branche waren von Beginn weg in der gesamten Entwicklungsphase im Rahmen der PHIS-Begleitgruppe mit einbezogen und konnten so direkt auf die Entwicklung des PHIS Einfluss nehmen. Auf diese Weise wurden die Interessen der Produzentinnen und Produzenten, der Bestandstierärztinnen und Bestandstierärzte, der Gesundheitsdienste und der Labore mitberücksichtigt.
Seit dem 1. Mai 2023 ist die PHIS-App für alle Tierärztinnen und Tierärzte in der Schweiz und Liechtenstein verfügbar und kann zur Dokumentation von Bestandsuntersuchungen in Schweinebeständen eingesetzt werden. Die Datenerfassung im Rahmen der Programme PathoPig und ZoE-BTA erfolgt seither ebenfalls über die PHIS-Anwendung, so dass auch diese Daten zusammen mit den übrigen PHIS-Daten für das Gesundheitsmonitoring zur Verfügung stehen.
Für den Betrieb des PHIS wurde an der Vetsuisse-Fakultät die Fachstelle PHIS geschaffen. Die Fachstelle kümmert sich um sämtliche Belange rund um das PHIS und ist insbesondere die erste Anlaufstelle für die Nutzerinnen und Nutzer der PHIS-Anwendungen bei Fragen und Problemen. Die Fachstelle PHIS ist zudem für die Betreuung und Administration der Programme PathoPig und ZoE-BTA zuständig.
Per 1. Januar 2024 wurde die Fachstelle PHIS im Auftrag des Bundesamts für Lebensmittelsicherheit und Veterinärwesen (BLV) und in Absprache mit sämtlichen Stakeholdern der Branche von der Vetsuisse-Fakultät an die Nutztierorganisation Schweiz (NTGS) übergeben, so dass auch nach Abschluss der Projektphase der Betrieb längerfristig gewährleistet ist. Mit Blick in die Zukunft wird die Fachstelle PHIS nun bei NTGS neu unter dem Namen Fachstelle AHIS geführt. Schliesslich schreitet die Entwicklung des «Cattle Health Info System» (CHIS) gut voran und wird mittelfristig mit dem PHIS zu einem gemeinsamen «Animal Health Info System» (AHIS) zusammengeführt.