Sans surprise, la protection des données est un sujet important qui est régulièrement abordé. Le projet PHIS se conforme bien entendu strictement aux prescriptions légales. Par ailleurs, il faut élaborer un concept qui tienne compte à la fois des souhaits et des besoins des détenteurs d’animaux et de ceux des vétérinaires. Il faut définir clairement les données qui sont collectées, les personnes qui y ont accès et le but dans lequel ces données sont finalement utilisées.

En principe, aucune donnée brute ne devrait être publiée. Seuls les résultats des analyses de données seront publiés sous une forme qui ne permet pas de les relier à des troupeaux ou des personnes. Un groupe de travail incluant des producteurs de porcs est chargé d’élaborer un concept de protection des données adapté.